Ketika Kouichi Sasakibara pindah ke sekolah barunya, dia dapat merasakan sesuatu yang menakutkan di atmosfer kelas barunya, rahasia yang tidak akan dibicarakan oleh mereka. Di tengah adalah gadis cantik Mei…

Kanie Seiya, seorang siswa sekolah menengah yang cerdas dan sangat narsis, percaya bahwa Sento Isuzu yang cantik namun pendiam telah mengundangnya berkencan di sebuah taman hiburan bernama Amagi Brilliant Park….

Ketika gadis-gadis muda telah menemukan kebenaran tentang nasib kejam seorang gadis penyihir, satu gadis penyihir setelah yang lain dihancurkan. Sepanjang itu semua, ada satu gadis penyihir yang terus bertarung sendirian…

Mengikuti penulisan ulang Madoka tentang alam semesta, mengorbankan dirinya sendiri dan hari-hari normal yang bahagia untuk menyelamatkan semua gadis penyihir dari takdir kejam yang menunggu mereka dengan menyeka penyihir dari…