Ketika gadis-gadis muda telah menemukan kebenaran tentang nasib kejam seorang gadis penyihir, satu gadis penyihir setelah yang lain dihancurkan. Sepanjang itu semua, ada satu gadis penyihir yang terus bertarung sendirian…

Mengikuti penulisan ulang Madoka tentang alam semesta, mengorbankan dirinya sendiri dan hari-hari normal yang bahagia untuk menyelamatkan semua gadis penyihir dari takdir kejam yang menunggu mereka dengan menyeka penyihir dari…