Takamachi Nanoha adalah siswa kelas empat yang normal yang merasa sedikit tidak berguna dan tidak pada tempatnya tanpa tujuan. Lalu suatu hari, dia menyelamatkan seekor musang, yang ternyata adalah penyihir…

Cerita ini berpusat di sekitar Negi Springfield, seorang penyihir berusia sepuluh tahun dari Wales, yang bermimpi menjadi Magister Magi seperti ayahnya yang hilang, seorang penyihir khusus yang menggunakan kekuatannya untuk…